《不一样的科学故事》叙述了会魔法的怪怪老师和学生发生在科学课堂上的有趣故事。怪怪老师带领学生们经历了一次次惊心动魄的大冒险，并在冒险的过程中融入科学知识。在地球保卫战中，全面了解地理知识；在帮外星人回家的宇宙旅途中，将天文知识一网打尽；与动植物悲欢离合的故事里，关于动物、植物的知识更加有趣......故事情节惊心动魄、想象力爆棚，让观众跟随主人公一起成长。故事中涵盖了小学生应该掌握的几乎所有科学知识和科学原理，在潜移默化中获取知识。