妖怪信箱中新到了一封来自女孩风祭华的求救信。最近，她的周遭连续发生奇怪事件。在鬼太郎一行赶到前，华被妖怪镜爷拖进了镜子里。接着镜爷又把鬼太郎的同伴分散吹到了全国各处，并将鬼太郎关进了镜中世界。鬼太郎历尽艰辛才从镜中世界里逃了出来。 远古时阎魔大王封印的野斗神觉醒了，他拥有凌驾于一切妖怪之上的强大力量。而风祭华正掌握着野斗神复苏的关键。知道了真相的鬼太郎决心守护少女华，拯救日本。四十七名妖怪汇集到一起，展开了一场前所未有的妖怪大战……