刚毕业的医学院学生保本，在父亲的介绍下，来到小石川诊所实习。他的老师是一位被称做红胡子的医师。起初保本对这个贫民窟厌恶之极，并迁怒于红胡子。红胡子是这里远近闻名的高手，他默默行医，不畏权贵，不计酬劳，手下治愈的病人包括因受虐精神失常的少妇，因酗酒导致半身麻木的醉汉，因被贩卖至青楼身患性病的雏妓等。在协助红胡子救死扶伤的过程中，保本逐渐发现了医德的重要，并修正了自己的人生态度。