被派往执行暗晶计划的信宝和焱，在完成为期一年的任务后，找到了研究暗物质的关键性情报并成功采集到暗物质。但在返回途中，AI焱因不认同人类文明，不愿让信宝成功返回，它借助旅途中采集的暗物质力量与信宝争夺水晶（时空穿梭的关键）。争夺中，水晶碎裂，碎片四散在故宫，信宝无法返回未来。而焱因为获得了一片水晶碎片，成功具有了实体。受到水晶碎片影响的故宫文物，古老灵魂被唤醒。信宝在小学生天天的帮助下，利用天天和各种文物的思考力与碎片共振，逐个提取出散落在文物身上的水晶碎片，恢复能量。而焱也一直运用水晶和暗物质的力量，从中作梗，抢夺水晶碎片。最终，信宝在天天和翡小玉、爷爷等人的帮助下，集齐水晶碎片，战胜焱，重返未来。